与身体的其他部位相比，大多数女性最先发现或者最先注意到荷尔蒙水平开始减少的部位就是阴道，尤其是那个部位的不适感。那么究竟发生了什么？
女性在生殖旺期，正常的雌激素的供给可以促进阴道细胞产生一种叫做糖原的物质，这是一种可以与阴道中其他自然生存的化合物相互反应的代谢糖。随着月经的循环，雌激素水平开始起伏，阴道壁上的细胞也会逐渐脱落—就像我们脸上和身上皮肤细胞的脱落一样。当这些富含糖原的细胞脱落后，它们开始和存在于阴道内的自然细菌起反应。这个生化反应的结果是产生了另一种叫做乳酸的化学物质，而乳酸可以使阴道中的pH值维持在一个适当的酸碱水平，也就是3.5~4.5之间。
然而，当孕激素下降，而雌激素水平开始跳起荷尔蒙的“探戈舞”，即没有规则地激升或剧降时，阴道细胞中的糖原成分也开始减少了。糖原减少导致了乳酸的下降，阴道里的酸碱度也开始发生改变，从而多种相关的、在医学上被统称为萎缩性阴道炎的症状将会出现，这包括：阴道干燥、灼痛、瘙痒、性交痛、阴道有压迫感并产生有异味的白带等。
阴道内部，女性的外阴和生殖器皮肤由于缺少雌激素而萎缩，并失去胶原和脂肪。阴蒂包皮可以收缩，使该部位暴露出来，并更容易由于坐姿、摩擦及内衣的束缚受到刺激。任何外部摩擦—包括性生活，则可引起阴蒂部位的肿胀和疼痛。外阴皮肤的变薄及阴道分泌物可以引起瘙痒，而瘙痒的结果会引起皮肤破损而感染。
如果女性的“禁区”感染的话，那所有这些症状都会进一步恶化。由于阴道内的酸碱度改变了，那些原先“友好”的细菌突然之间会扮演起卑鄙的坏角色来—从一个健康保护者转变成可以带来感染的侵略者。这也就是为什么细菌性阴道炎、酵母菌感染，或者毛滴虫感染等在成熟女性中间如此普遍的原因。
此外，一旦生殖系统失去雌激素的营养，就会发生饥饿退化。最先受影响的是阴道液体的分泌。阴道在性激发及性生活过程中不能保持平时的湿度，因此不能起正常的润滑作用。这个“干燥带”的出现是由于阴道壁的血流减少，子宫内膜细胞减少导致宫颈生成的黏液减少，因此宫腔分泌的液体也减少了。在一个称为萎缩的过程中，阴道壁变薄了，不那么富有弹性。以前允许壁膨胀分娩出婴儿的有弹性的皱褶也变得平整，继而消失了。薄的、弹性差的表面容易在性生活时受外伤出血。如果性生活不活跃，在接触表面可以形成瘢痕。同时由于阴道血流减少，性激发过程中的充血就会减少，因此可以影响正常的性刺激过程和性高潮。
最后，随着雌激素和孕激素越来越不平衡，在阴道壁上堆积的胶原和弹性纤维开始肿胀，并融合在一起，这样便使得阴道壁失去了依托的力量，从而导致尿失禁。根据坐落于旧金山的加州医科大学的泌尿学教授理查德·史密德的说法，“控制着骨盆及女性生殖器的神经中含有高密度的雌激素受体，而荷尔蒙水平的波动可以影响此神经传导的兴奋度，从而使许多中年女性有一种总想要上厕所的感觉。”
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